研究員為做研究切三萬多個(gè)西瓜(4)
“我以前皮膚是很白的，“鄧云笑著說道，”但是在地里做育種工作這么多年，很難不曬黑，我們團(tuán)隊(duì)其他育種家都和我膚色差不多?！?/p>
接受采訪前，鄧云剛走出北大農(nóng)研院的育種大棚。
也正是對(duì)每份西瓜材料都了如指掌，才能使他們?cè)诤笃谕陡?，面?duì)審稿人質(zhì)疑“材料不對(duì)“時(shí)，第一時(shí)間不是自我懷疑，而是擺出證據(jù)。
他們花費(fèi)近一個(gè)月的時(shí)間，仔細(xì)查找材料信息和審稿人的相關(guān)文章，并與種質(zhì)資源庫負(fù)責(zé)人進(jìn)一步核實(shí)后，委婉回復(fù)了對(duì)方。
“作為一個(gè)研究了西瓜四十多年的人，張興平老師可以說是全世界對(duì)西瓜最了解的人?！编囋菩χf，“我們對(duì)材料是非常自信?！?/p>
鄧云（左）和張興平（右）在調(diào)查植株生長(zhǎng)情況
鄧云（左）和張興平（右）在調(diào)查瓜
張興平在調(diào)查西瓜，發(fā)現(xiàn)好的組合
握緊接力棒向構(gòu)建西瓜屬超級(jí)泛基因組圖譜沖刺
構(gòu)建T2T水平超級(jí)泛基因組的過程，如同一場(chǎng)三棒接力賽。第一棒是深入田間地頭，種植材料，不斷取樣，第二棒送樣測(cè)序，第三棒則是數(shù)據(jù)分析。
田間濕透衣服的第一棒完成后，就到了測(cè)序階段。
應(yīng)用最先進(jìn)的HiFi、HiC和、ONT等三代測(cè)序技術(shù)，雖然完成了基因組的初組裝，但是仍然難以做到全部實(shí)現(xiàn)T2T和無缺口的組裝。
2021年底，隨著李博生加入團(tuán)隊(duì)，利用自己研發(fā)的選擇性測(cè)序方法和超長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)填補(bǔ)了基因組的存在和端粒，全部基因組均實(shí)現(xiàn)了T2T和無缺口的組裝。
繼李博生完成測(cè)序工作后，何航帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)夜以繼日完成最后沖刺，常常做數(shù)據(jù)分析做到半夜兩三點(diǎn)。
每?jī)芍荛_一次組會(huì)，討論進(jìn)展、分析結(jié)果、分享新的發(fā)現(xiàn)，是接力賽順利完成交接棒的原因。
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