研究員為做研究切三萬多個(gè)西瓜(3)

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2024-08-07 09:49:38 中國科學(xué)報(bào)

和美國農(nóng)業(yè)部專家進(jìn)行視頻溝通

和國外測序公司視頻會(huì)議

比西瓜還要了解西瓜

西瓜要一口一口吃，目標(biāo)也要一步步實(shí)現(xiàn)。

泛基因組是一個(gè)物種中所有個(gè)體基因組信息的總和，構(gòu)建泛基因組可以有效解決單一參考基因組帶來的信息缺失和分析偏差。而超級泛基因組則代表一個(gè)屬內(nèi)所有物種的基因組信息，尤其蘊(yùn)含了野生種中豐富的基因組變異，是對泛基因組的進(jìn)一步擴(kuò)展，在遠(yuǎn)緣雜交和基因發(fā)掘等方向具有重要應(yīng)用前景。

想要將野生西瓜中的抗病耐逆優(yōu)良基因?qū)氲皆耘辔鞴?，最好先得到野生西瓜的參考基因組，然后再構(gòu)建包含所有野生種的西瓜屬超級泛基因組。

收集西瓜屬全部7個(gè)種的代表性材料成為團(tuán)隊(duì)首要解決的問題。

項(xiàng)目啟動(dòng)時(shí)團(tuán)隊(duì)已收集了五個(gè)種的材料，并從中國農(nóng)

科院

國家種質(zhì)資源研究庫引進(jìn)第六個(gè)種。而最后一個(gè)種也就是諾典西瓜的獲取，困擾團(tuán)隊(duì)許久。

從國外引進(jìn)種質(zhì)資源程序復(fù)雜、審核嚴(yán)格，團(tuán)隊(duì)歷經(jīng)千難險(xiǎn)阻終于拿到了諾典西瓜的種子，然而播種后一個(gè)月、兩個(gè)月都沒有一點(diǎn)發(fā)芽跡象。團(tuán)隊(duì)想盡辦法，用赤霉素處理、組培等等方法都進(jìn)行了嘗試，最終均以失敗告終。

“后來，張興平老師得知美國農(nóng)業(yè)部種質(zhì)資源中心有我們所需要這份材料，而且有植株，我們立刻聯(lián)系相關(guān)負(fù)責(zé)人以及美國測序公司，由美國農(nóng)業(yè)部種質(zhì)資源中心的合作伙伴取樣后送到測序公司，公司進(jìn)行測序后再將結(jié)果反饋給國內(nèi)?！班囋苹貞洝?/p>

回顧如何解決，鄧云解釋輕松，兩三句話就將耗時(shí)一整年多的過程概括完成。

在他們看來，這只是實(shí)現(xiàn)目標(biāo)的必經(jīng)歷程，沒有難易點(diǎn)之分，只要完成即可。被曬得黝黑的皮膚，在大棚里濕透的衣服，都只是過程。

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