對于自然科學(xué)基金會(huì)的設(shè)計(jì)，李政道也提出了具體的建議，比如基金應(yīng)該完全用在自然科學(xué)的基礎(chǔ)科學(xué)研究和應(yīng)用基礎(chǔ)研究上；委員會(huì)必須要有濃厚的學(xué)術(shù)意識，必須有獨(dú)立性，把權(quán)交給科學(xué)家，不能在上面還有一個(gè)行政機(jī)構(gòu)來管，不然很難做出公正的評價(jià)；委員會(huì)負(fù)責(zé)人必須是第一流的科學(xué)家，對基礎(chǔ)科學(xué)、應(yīng)用基礎(chǔ)科學(xué)有個(gè)人經(jīng)驗(yàn)和全面了解；重視和加強(qiáng)基礎(chǔ)研究和應(yīng)用基礎(chǔ)研究是一個(gè)長期的想法，方針不能老改變，要穩(wěn)定下來。

鄧小平表示同意，他說，這是個(gè)新生事物，先干起來再說。緊接著，1986年2月，國家自然科學(xué)基金委員會(huì)成立，李政道擔(dān)任了名譽(yù)顧問?；鹞牡谝粚弥魅翁瓢綉c提出了“依靠專家、發(fā)揚(yáng)民主、擇優(yōu)支持、公正合理”的評審原則，貫徹至今。

6.為有源頭活水來

國家自然科學(xué)基金委員會(huì)主要是資助基礎(chǔ)研究。其實(shí)，從1972年回國起，李政道就反復(fù)論述基礎(chǔ)研究的重要性，提醒如果沒有基礎(chǔ)研究的源頭活水，就不會(huì)有先進(jìn)的科技應(yīng)用。在1980年代中期，他首創(chuàng)“水、魚、魚市場”來比喻基礎(chǔ)、應(yīng)用、開發(fā)三類研究的關(guān)系，之后也經(jīng)常提及。

在基礎(chǔ)、應(yīng)用、開發(fā)三類研究中，帶有源頭創(chuàng)新特點(diǎn)的基礎(chǔ)科學(xué)研究是極為重要的。李政道反復(fù)強(qiáng)調(diào)基礎(chǔ)研究“牽一發(fā)動(dòng)全身”的引領(lǐng)性作用——

“作為一個(gè)有悠久歷史和文化的民族，要對人類的發(fā)展有所貢獻(xiàn)，不能對基礎(chǔ)科學(xué)研究采取消極的態(tài)度。坐等的思想肯定是不對的。假如只是一味地等待，一旦有新的科學(xué)發(fā)現(xiàn)出來，再來學(xué)習(xí)掌握，一定會(huì)落后于人?？茖W(xué)研究就像海洋里的浪頭一樣，一個(gè)浪、一個(gè)浪地過去。當(dāng)一個(gè)浪達(dá)到最高峰的時(shí)候，其下一步必定要下落，然后新的浪頭再出來。所以，你只看見別人浪頭高，就一味地跟著去追，而自己不去找新的、將成為巨浪的新浪頭，結(jié)果人家的浪頭下去了，又去作別的了，你還在跟著別人走，這樣永遠(yuǎn)不會(huì)發(fā)展、不會(huì)發(fā)達(dá)、不會(huì)領(lǐng)先。你要發(fā)達(dá)，你必須要自己找到新的浪頭，看準(zhǔn)新的浪頭是從哪里開始的，在它還沒有達(dá)到最高峰時(shí)，最好在它剛要開始的時(shí)候就將它抓住，使它達(dá)到最高峰?！?/p>